邮箱：yangqin00055@hnu.edu.cn
办公地点：长江大学（东校区）物理与光电工程学院419室
研究方向：多组学融合疾病识别和致病机理、机器学习算法、
疾病基因突变及代谢通路
导师类型：物理学/光学工程硕导
个人简介：
杨琴，1982年生，副教授，硕士生导师。研究内容：（1）多组学融合疾病识别和致病机理：基于基因组学、蛋白质组学和代谢组学扩展对新生儿代谢缺陷罕见疾病的病理信息描述，建立多组学融合疾病识别模型，为疾病的致病机理研究和精准治疗提供科学依据和智力支持；（2）机器学习算法研究：针对组学数据存在高维小样本的特点，探讨深度学习对其进行高质量样本生成和建模的可行性，为提高模型性能奠定基础；（3）疾病基因突变及代谢通路研究：基于多组学检测数据进行生物信息学分析，提高人们对新生儿代谢缺陷罕见疾病的基因突变及代谢通路的认识。先后以通讯作者和第一作者身份在国际知名SCI源刊物Talanta、Microchemical Journal、Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems等发表多篇文章，在生物信息学、化学计量学和相关化学信息学上积累丰富经验，并申请国家发明专利4项，已授权3项，已授权计算机软件著作权2项。
教育/工作经历：
2017年7月-至今 长江大学，物理与光电工程学院，副教授
2007年7月-2013年8月 长江大学，物理与光电工程学院，讲师
2013年9月-2017年6月 湖南大学，分析化学专业，博士学位，导师：俞汝勤院士
2004年9月-2007年6月 中国地质大学（武汉），分析化学专业，硕士学位，导师：杨勇教授
2000年9月-2004年6月 中国地质大学（武汉），物理学专业，学士学位，导师：杨勇教授
科研项目情况：
1. 国家自然科学基金青年基金，主持，2018年，22万
2. 湖北省教育厅中青年人才项目，主持，2017年，2万
3. 湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室开放基金，主持，2024年，3万
4. 国家自然科学基金重大项目，参与，2014年，200万
5. 河南省重点研发项目，参与，2025年，200万
6. 深圳市科技计划基础研究（学科布局）项目，参与
7. 深圳市发改委项目等项目，参与
代表性论文：
[1]Ze-Yu Li, Xiao-Ying Liu, Wen Xiao, Jiang-Tao Yang, Pan-Pan Jiang, Ben-Qing Wu, Xiang-Ju Liu, Ming Xue, Hui-Jing Lv, Shi-Hao Zhou, Qin Yang*, Lu Xu*, Yan-Ling Yang*. Systematic characterization and efficient prediction of cobalamin C deficiency clinical phenotypes using network analysis and deep learning on multi-omics data. Microchemical Journal. 2024, 207:112018. (SCI, 中科院 2 区 Top/T2, IF=4.9)
[2] Lu Xu*, Xi-Hui Bian, Qin Yang*. H-type indices with applications in chemometrics: h accuracy index for evaluating and comparing errors in analytical chemistry. Journal of Analytical Methods in Chemistry. 2024, 1580359. (SCI, 中科院 3 区, IF=2.3).
[3] Ze-Yu Li, Xiao-Ying Liu, Guo-Fu Ji, Wei Zhou, Pan-Pan Jiang, Qin Yang*, Ben-Qing Wu, Yan-Ling Yang. UHPLC-QE-Orbitrap MS Combined with Network Analysis and Chemometrics for Systematic Characterization and Prediction of Cobalamin C Deficiency Clinical Phenotypes. Journal of Instrumental Analysis. 2024, 已录用. (中文核心, T3)
[4] Lu Xu*, Qin Yang*. Deep electron cloud-activity and field-activity relationships. Journal of Chemometrics. 2023, 37: e3503. (SCI, 中科院 4 区, IF=1.9)
[5] Lu Xu*, Qin Yang*. Artificial Intelligence and Big Data Analysis of Electron Cloud Density. Journal of Chemistry. 2023, 12: 1-7. (SCI, 中科院 4 区, IF=2.8)
[6] Wen Xiao, Qian-Qian Niu, Zhi-Yong Sun, Juan Xiong, Qin Yang*, Ben-Qing Wu*, Lu Xu*, Yan-Ling Yang, Ru-Qin Yu. Efficient mass spectrometric characterization and classification of methylmalonic aciduria subtypes through urinary and blood metabolic profiles fusion. Microchemical Journal. 2022, 181: 107754. (SCI, 中科院 2 区 Top/T2, IF=4.9)
[7] Wen Xiao, Qian-Qian Niu, Zhi-Yong Sun, Qin Yang*, Ben-Qing Wu. Early Detection of Glutaric Acidemia Type I by Urinary Metabolomics Analysis Based on Gas Chromatography-Mass Spectrometry Coupled with Chemometrics. Journal of Instrumental Analysis. 2022, 41:1577-1583. (中文核心, T3)
[8] Qin Yang, Bing-Hao Shi, Guo-Li Tian, Qian-Qian Niu, Jia Tang, Dan-Dan Linghu, Hong-Qin He, Ben-Qing Wu*, Jiang-Tao Yang, Lu Xu*, Ru-Qin Yu. GC-MS urinary metabolomics analysis of inherited metabolic diseases and stable metabolic biomarker screening by a comprehensive chemometric method. Microchemical Journal. 2021, 168: 106350. (SCI, 中科院 2 区 Top/T2, IF=4.9)
[9] Lu Xu, Qin Yang*, Qingsong Xu*. H-type indices with applications in chemometrics I: h-multiple similarity
index. Journal of Chemometrics. 2021, 35: e3365. (SCI, 中科院 4 区, IF=1.9)
[10] Qin Yang, Lu Xu*, Guo-Li Tian, Ben-Qing Wu. H-type indices with applications in chemometrics II: h-outlyingness index. Journal of Chemometrics. 2021, 35: e3375. (SCI, 中科院 4 区, IF=1.9)
[11] Qin Yang, Guo-Li Tian, Jia-Wei Qin, Ben-Qing Wu, Lin Tan, Lu Xu*, Si-Zhan Wu, Jiang-Tao Yang, Jian-Hui Jiang*, Ru-Qin Yu. Coupling bootstrap with synergy self-organizing map-based orthogonal partial least squares discriminant analysis: Stable metabolic biomarker selection for inherited metabolic diseases. Talanta. 2020, 219:121370. (SCI, 中科院 1 区/T1, IF=5.6)
[12] Qin Yang, Lin Tan, Ben-Qing Wu, Guo-Li Tian, Lu Xu*, Jiang-Tao Yang, Jian-Hui Jiang*, Ru-Qin Yu. Beyond one-against-all (OAA) and one-against-one (OAO): An exhaustive and parallel half-against-half (HAH) strategy for multi-class classification and applications to metabolomics. Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems. 2020, 204:104107. (SCI, 中科院 2 区/T2, IF=3.7)
[13] Qin Yang, Lu Xu*, Li-Juan Tang, Jiang-Tao Yang*, Ben-Qing Wu*, Nan Chen, Jian-Hui Jiang, Ru-Qin Yu. Simultaneous detection of multiple inherited metabolic diseases using GC-MS urinary metabolomics by chemometrics multi-class classification strategies. Talanta. 2018, 186: 489-496. (SCI, 中科院 1 区/T1, IF=5.6)
[14] Qin Yang, Sui-Ping Wang, Xin-Liang Yu, Xiao-Hai Yang, Qiu-Ping Guo, Li-Juan Tang, Jian-Hui Jiang*, Ru-Qin Yu*. A novel nucleic acid sequence encoding strategy for high-performance aptamer identification and the aid of sequence design and optimization. Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems. 2017, 170: 32-37. (SCI, 中科院 2 区/T2, IF=3.7)
[15] Qin Yang, Hong-Yan Zou, Yan Zhang, Li-Juan Tang, Guo-Li Shen, Jian-Hui Jiang*, Ru-Qin Yu*. Multiplex protein pattern unmixing using a non-linear variable-weighted support vector machine as optimized by a particle swarm optimization algorithm. Talanta. 2016, 147: 609-614. (SCI, 中科院 1 区/T1, IF=5.6)
[16] Qin Yang, Li-Juan Tang*, Ru-Qin Yu*. Efficient pattern unmixing of multiplex proteins based on variable weighting of texture descriptors. Analytical Methods. 2016, 8: 8188-8195. (SCI, 中科院 3 区, IF=2.7)
荣誉获奖：
荣获第六届妇幼健康科学技术奖“科技成果奖”一等奖 2025年10月
荣获长江大学科研项目立项贡献奖 2019年12月
指导研究生刘小莹获“华为杯”第七届中国研究生人工智能创新大赛三等奖（B类赛事）2025年12月
指导本科生王孜旭获第七届全球校园人工智能算法精英大赛国赛三等奖 2025年12月
指导本科生王翰林获第十六届中国大学生计算机设计大赛中南地区赛二等奖 2023年6月
指导研究生肖雯获“华为杯”第四届中国研究生人工智能创新大赛三等奖（B类赛事）2022年12月
发明专利：
1．杨琴，用于新生儿疾病筛查的智能化采血设备(ZL202210714919.1)
2．杨琴，一种新生儿筛查用样本箱(ZL202110696899.5.)
3．杨琴，一种新生儿筛查用采集样本的运输存储装置(ZL202110591294.X)
4．杨琴，基于自组织映射的集成策略用于疾病稳健标志物筛选软件V1.0.(2021SR0907607)
5．杨琴，基于混合扰动集成方法的疾病稳健标志物筛选软件V1.0.( 2021SR0907604)
主要社会及学术兼职及学术交流：
担任《罕少疾病杂志》通讯编委
担任Scientific Reports、Microchemical Journal、Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems审稿专家
深圳罕见病代谢组学精准医学工程研究中心、广东省院士企业工作站（数据挖掘及模型构建）特聘教授
中国妇幼健康研究会营养代谢与遗传病防治专业委员会委员
参加2025年临床实验室质谱技术应用与管理培训班 汇报题目：机器学习、 数据挖掘、 计量学与遗传代谢病, 2025.10.19
参加中国妇幼健康研究会儿童发育与疾病专委会换届大会暨学术研讨会 汇报题目：机器学习在新生儿遗传代谢病筛诊疗研的探索, 2024.4.20；
参加2024年气相色谱质谱联用技术临床应用标准化及质量控制培训班 汇报题目：机器学习在新生儿遗传代谢病筛诊疗研的探索, 2024.10.20
指导研究生：
肖雯（物理学硕士，2021级）
李泽宇（物理学硕士，2022级）
刘小莹（物理学硕士，2023级）
王常（光学工程硕士，2024级）
吴梦琪（物理学硕士，2025级）
联系方式：yangqin00055@hnu.edu.cn
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